遗传学团队魏闻老师在致病菌自发性进化方面取得新进展,研究论文“Mutation landscape of base substitutions, duplications, and deletions in the representative current cholera pandemic strain.”发表在Genome Biology & Evolution上。论文第一作者为魏闻副研究员,该项目受到国家自然科学基金的支持。
霍乱弧菌(Vibrio cholerae)是人类霍乱的病原体,从1961年开始,第七次流行性霍乱开始在全世界大规模爆发,目前仍然在全世界肆虐,每年数百万人感染霍乱。霍乱弧菌群体进化比一般致病菌快,在第七次流行性霍乱弧菌基因组中,病原岛特别是CTX区域表现形式多样,是导致霍乱弧菌长时期全球性扩张的原因。本研究通过实验室进化研究霍乱弧菌的自发性进化,发现了CTX区域具有自发性的高突变率,主要表现为duplication和deletion。对于细菌而言,自发的duplication和deletion是较为稀少的,霍乱弧菌的病原岛变化可能和其可移动性机制有关。暗示第七次流行型霍乱弧菌CTX区域多样化可能是自发的过程。同时也发现霍乱弧菌在营养丰富情况下突变率(SNV和indel)显著升高,并直接表现为一号染色体突变率显著升高。进一步研究表明,此现象与霍乱弧菌在营养丰富情况下的快速复制有关,一号染色体的overlap replication机制虽然提高了复制效率,但同时也提高了碱基错配概率。