应生命科学学院张泽教授邀请,东京大学Hirohisa Kishino教授于2013年6月3日至7日到访了重庆大学。访问期间,Kishino教授与张泽教授研究组的青年老师、研究生进行了深入的学术交流,并提出了大量的宝贵意见。6月5日下午,Kishino教授在生命科学大楼625会议室做了题为“spatio-tempporal modeling of adaptive mutations” 的精彩学术报告。
Kishino教授系统地介绍了HIV病毒的vif基因的正选择作用以及vif基因的部分密码子的功能约束作用。人类的APOBEC3G(A3G)蛋白活性通过把HIV病毒的DNA由G突变成A来行驶其免疫功能,如果这个突变不足以把病毒的开放读码框破坏,就会产生病毒的新突变种,为了抵抗人类的免疫系统,病毒编码了Vif蛋白来结合人类的A3G蛋。Kishino教授发现HIV病毒的vif基因的一些密码子区域:78-154,85–154, 101–157, 105–157以及105–176与CD4+ T细胞数目有关,这些密码子部分位于LGQGVSIEW区域并且属于BC-BOX区域。并且,他们小组也鉴定出了Vif蛋白N端的一部分密码子受到了正选择的作用,这些密码子位于WKSLVK与YRHHY区域。而所有这些区域都参与到了Vif蛋白诱导的A3G/F复合体的降解以及参与到Vif蛋白的N端结合到病毒与细胞的RNA结合。结果证明,vif的适应性进化不仅有利于结合病毒的RNA,并有利于识别A3G/F复合体。此外,由于Vif的蛋白结构还没有被完全解析,与CD4+ T细胞数目有关的密码子区域的鉴定可帮助我们研究其他病毒的与宿主细胞因子作用的关键区域。